1962년 미국 헤퍼 프로젝트(Heifer Project)를 통해 젖소 10마리를 기증받아 연세대학교 캠퍼스 내(현 대운동장 옆 언덕)에서 ‘연세목장’을 시작한 것이 연세유업의 출발점이다. 연세유업은 국내 유업계에서 두 번째로 오랜 역사를 가진 기업으로, 1967년 연세대학교 농업개발원내 우유처리장을 개설하여 본격적으로 유가공 사업을 시작하였다.
1978년에는 학교법인 연세대학교의 수익사업체로 전환되었으며, 1993년에는 충청남도 아산에 최첨단 유제품 공장을 준공하여 생산 기반을 확충하였다.
연세유업은 고품질의 유제품, 식품 및 건강기능식품의 생산·판매를 통해 국민 건강 증진과 연세대학교 교육재원 확보라는 미션을 성실히 수행하고 있다.